Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sfmbt1Q9JMD1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms