Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrfQ9JM73 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SrfQ9JM73 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SrfQ9JM73 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SrfQ9JM73 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SrfQ9JM73 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SrfQ9JM73 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SrfQ9JM73 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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SrfQ9JM73 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SrfQ9JM73 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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