Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Col5a3Q9JLI2 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Col5a3Q9JLI2 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Col5a3Q9JLI2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Col5a3Q9JLI2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Col5a3Q9JLI2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Col5a3Q9JLI2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Col5a3Q9JLI2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Col5a3Q9JLI2 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Col5a3Q9JLI2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Col5a3Q9JLI2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Col5a3Q9JLI2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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