Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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CtsmQ9JL96 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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CtsmQ9JL96 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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CtsmQ9JL96 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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CtsmQ9JL96 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CtsmQ9JL96 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
CtsmQ9JL96 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CtsmQ9JL96 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
CtsmQ9JL96 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtsmQ9JL96 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtsmQ9JL96 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtsmQ9JL96 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtsmQ9JL96 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CtsmQ9JL96 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms