Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FancaQ9JL70 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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FancaQ9JL70 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FancaQ9JL70 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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FancaQ9JL70 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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FancaQ9JL70 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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FancaQ9JL70 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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FancaQ9JL70 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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FancaQ9JL70 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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FancaQ9JL70 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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FancaQ9JL70 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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FancaQ9JL70 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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FancaQ9JL70 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FancaQ9JL70 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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