Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Scamp5Q9JKD3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Scamp5Q9JKD3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms