Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Riox1Q9JJF3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms