Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
DysfQ9ESD7 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms