Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ube3bQ9ES34 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ube3bQ9ES34 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms