Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnft1Q9DCN7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms