Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf6Q9DBU5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf6Q9DBU5 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf6Q9DBU5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rnf6Q9DBU5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf6Q9DBU5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf6Q9DBU5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf6Q9DBU5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf6Q9DBU5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rnf6Q9DBU5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf6Q9DBU5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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