Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smg9Q9DB90 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms