Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cyp2c55Q9D816 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms