Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tmem54Q9D7S1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms