Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Capns2Q9D7J7 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms