Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Cldn23Q9D7D7 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn23Q9D7D7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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