Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Nop56Q9D6Z1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Nop56Q9D6Z1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Nop56Q9D6Z1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Nop56Q9D6Z1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Nop56Q9D6Z1 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Nop56Q9D6Z1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Nop56Q9D6Z1 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nop56Q9D6Z1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Nop56Q9D6Z1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Nop56Q9D6Z1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Nop56Q9D6Z1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nop56Q9D6Z1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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