Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc7Q9D541 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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