Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Phf6Q9D4J7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Phf6Q9D4J7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Phf6Q9D4J7 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Phf6Q9D4J7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms