Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cfap53Q9D439 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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