Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Snapc3Q9D2C9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms