Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Syf2Q9D198 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms