Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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Zbed3Q9D0L1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Zbed3Q9D0L1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Zbed3Q9D0L1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Zbed3Q9D0L1 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Zbed3Q9D0L1 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Zbed3Q9D0L1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Zbed3Q9D0L1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Zbed3Q9D0L1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Zbed3Q9D0L1 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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