Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc47Q9D024 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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