Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX47

Xrcc2, DNA repair protein XRCC2, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc2Q9CX47 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Xrcc2Q9CX47 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms