Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prkrip1Q9CWV6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms