Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Malsu1Q9CWV0 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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