Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9CWU4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9CWU4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Q9CWU4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms