Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Smim8Q9CQQ0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Smim8Q9CQQ0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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