Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nicn1Q9CQM0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Nicn1Q9CQM0 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Nicn1Q9CQM0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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