Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Prpf8Q99PV0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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