Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mrpl3Q99N95 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Mrpl3Q99N95 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Mrpl3Q99N95 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Mrpl3Q99N95 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Mrpl3Q99N95 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl3Q99N95 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms