Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac9Q99N13 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Hdac9Q99N13 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hdac9Q99N13 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hdac9Q99N13 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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