Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SrrtQ99MR6 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SrrtQ99MR6 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms