Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Sh3bp5lQ99LH9 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sh3bp5lQ99LH9 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sh3bp5lQ99LH9 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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