Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps4Q99KG7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps4Q99KG7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms