Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmed9Q99KF1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms