Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Usp11Q99K46 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Usp11Q99K46 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Usp11Q99K46 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Usp11Q99K46 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Usp11Q99K46 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp11Q99K46 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp11Q99K46 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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