Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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TrabdQ99JY4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TrabdQ99JY4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TrabdQ99JY4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TrabdQ99JY4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TrabdQ99JY4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms