Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ddb2Q99J79 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms