Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Apobec3Q99J72 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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