Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atl3Q91YH5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms