Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cacng8Q8VHW2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cacng8Q8VHW2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms