Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smg8Q8VE18 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms