Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ubxn4Q8VCH8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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