Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RfxapQ8VCG9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RfxapQ8VCG9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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