Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC51

Wrap53, Telomerase Cajal body protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wrap53Q8VC51 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Wrap53Q8VC51 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms