Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW8

Ttc36, Tetratricopeptide repeat protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc36Q8VBW8 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ttc36Q8VBW8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ttc36Q8VBW8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ttc36Q8VBW8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ttc36Q8VBW8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ttc36Q8VBW8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ttc36Q8VBW8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc36Q8VBW8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms