Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Top1mtQ8R4U6 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Top1mtQ8R4U6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms