Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nup58Q8R332 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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